مركز تحقیقات بيولوژي و بیوتكنولوژی تولیدمثل و نازايي در سال ۱۳۷۷، به همت جمعی از متخصصان علوم پایة پزشكی و درمان ناباروری، با تصویب هیأت امنای جهاد دانشگاهی تأسیس شد. در تاریخ ۱۹/۴/۷۸، مجوز تأسیس مركز تحقیقات بیوتكنولوژی تولیدمثل، به استناد رأی شورای گسترش دانشگاه‌های علوم پزشكی وزارت بهداشت درمان و آموزش پزشكی، از سوي وزیر محترم بهداشت درمان و آموزش پزشكی وقت، صادر شد.

اين پژوهشكده، هم‌اكنون با برخورداری از سه گروه پژوهشی پزشکی فرد محور در سلامت باروری، جنین شناسی و آندرولوژی و ایمونوبیولوژی تولید مثل طرح‌های پژوهشی متعددی را درباره موضوعات مرتبط با اولویت‌ها و محورهای فعالیت خود، با تأمین بودجه از منابع داخلی و بین‌المللی، در دست انجام دارد. از جمله وجوه متمايز كننده اين پژوهشكده، همكاری و فعالیت پژوهشي متخصصان علوم پایه پزشكی، (جنین شناسی، ایمونولوژی، ژنتیك، بیوشیمی، بیولوژی سلولی و مولكولی و متخصصان بالینی، زنان و زایمان و نازایی، آندرولوژی، غدد درون‌ریز، عفونی و بیماری‌های گرمسیری و ...) ، در كنار یكدیگر، در انجام طرح‌های پژوهشی و درمانی است. با توجه به نوپايي نسبی علوم تولیدمثل و ناباروری و گسترش سریع آن در دودهه گذشته، گستره‌اي وسیع از پژوهش‌ها فراروی محققان قرارگرفته است كه البته، دستیابی و برنامه‌ریزی برای تمام این جنبه‌ها امكان پذیر نیست. از اين‌رو، این پژوهشكده اولویت‌های تحقیقاتی خود را، در حیطه تولیدمثل و ناباروری، بر محورهاي سقط مكرر، اندومتریوز، ناباروری با علت نامشخص، سلول‌های بنیادی، حیوانات ترانسژنیک، جنین، ناباروری در مردان و زنان با علل ژنتیکی و عفونت تولیدمثل متمركز كرده است.

تاكنون با تلاش اعضاء محترم هیأت علمی این پژوهشكده، از طرح‌های متنوع تحقیقاتی پايان یافته و یا در دست اجرا، تعداد زیادی مقاله داخلی، مقالة بین‌المللی، خلاصه مقاله‌هاي داخلی و خلاصه مقاله‌هاي بین‌المللی منتشر شده است.

از موارد قابل توجه در فعاليت‌هاي این پژوهشكده، تأسیس مركز فوق تخصصي درمان ناباروری و سقط مكرر ابن‌سینا است كه با همكاری مركز درمان ناباروری لوبك (Lubeck) آلمان و زیرنظر دانشمند برجسته و از پيشگامان IVF در ایران، پروفسور صفا الحسنی، تأسیس شد.

همچنین تاسیس مرکز خدمات تخصصی بایوفارم که با حمایت پژوهشگاه و جهاد دانشگاهی در مجتمع شهدای جهاد دانشگاهی (هلجرد) راه اندازی و در زمینه تولید آزمایشگاهی جنین از نژاد های ممتاز گاوهای شیری، گوشتی و دومنظوره فعالیت می کند.