پژوهشگاه ابن سینا دارای 3 پژوهشکده می باشد که شرح هر کدام با توجه به لینکهای ذیل قابل نمایش می باشد.

پژوهشکده بیوتکنولوژی تولید مثل
	گروه پژوهشی ایمونولوژی تولیدمثل گروه پژوهشی ژنتیک توليدمثل و بيوتكنولوژي گروه پژوهشی عفونت‌هاي توليدمثل گروه پژوهشی جنين‌شناسی و آندرولوژي گروه پژوهشی حقوق و اخلاق زیستی
پژوهشکده آنتی بادی مونوکلونال
	گروه پژوهشی هیبریدوما گروه پژوهشی ایمونوشیمی گروه پژوهشی مهندسی آنتی بادی ـ آنتی ژن
پژوهشکده نانوبیوتکنولوژی
	گروه پژوهشی نانوتکنولوژی گروه پژوهشی تکنولوژی نوترکیب گروه پژوهشی نانوبیوسنتز